1.礦物質養分消耗嚴重

園林樹苗需在圃立地養護多年，從土壤中洗手的礦物質養分需要比農作物多。如：對一年生雜交楊測定，其每畝年需肥量：N素10.1kg，P2O5，2.9kg，K2O 7.5kg。

有人用土壤分析方法計算無根土壤與根區土壤中養料差額時發現，若以苗木生長最旺盛、吸收養料最多時為標準，則實際吸收利用的養料數量，比上述苗木需肥量大幾倍至十幾倍。經營多年的園林苗圃更應考慮土壤養分的及時補充，避免掠奪式經營。

2.耕作層營養土損失嚴重

土壤耕作層經多年耕作培養，其物理性質和化學性質都較為適合作物生長，人們稱之為熟土。但園林苗圃出于苗木移植成活的需要，保護根系不受機械損傷，要求夾帶土坨出圃。樹木規格愈大，土坨規格也愈大。按檜柏綠籬苗出圃統計，一畝地綠籬苗定植養護三年，出圃時將帶走50M3耕作土，使原地表下降8cm。農業稱耕作層為犁層，其深度為20-30cm。可見綠籬苗一次出圃，將損失耕作層營養土的近1/3。如果是大規格常綠苗木出圃，土坨直徑一般要求60-80cm，損失會更大。

3.重茬種植、單項養分短缺

園林苗木生長周期較長，培育苗木規格較大，相對在圃養護時間長。除去一些花灌木2-3年即可出圃外，落葉喬木都要5-6年，而常綠喬木則要十幾年，甚至二三十年。一個樹種在同一營養環境下長時間生存，有同于農作物的連作。土壤中某些所需養分元素必然短缺，一些有害物質、有害微生物必然積累。如苗圃在種植坪面安排上再忽略了樹種重茬，土壤肥力一定會削弱。對新建園林苗圃可能反應不會很大，大、中型老的園林苗圃必須重視這個問題。